（1）飲水機長時間不清洗消毒或從未清洗消毒過，很容易對本來合格的桶裝水造成二次污染。國內一些大中城市的權威檢測機構的研究證實，如果消費者使用的飲水機長時間不清洗消毒或從未清洗消毒，無論是礦泉水還是純凈水，水質當天就受到來自飲水機的二次污染，主要污染物為菌落總數(shù)和大腸菌群，隨后幾天微生物數(shù)量還會急速增加，細菌總數(shù)嚴重超出國家生活飲用水衛(wèi)生標準，酵母菌、霉菌等增長顯著。也就是說，這些飲水機出水不如自來水衛(wèi)生。

（2）結垢問題。燒水時產生的水垢即碳酸鹽沉淀物，會影響熱交換效率，結垢嚴重時，會帶來安全隱患。

（3）長時間加熱的問題。飲水機的加熱溫度為85℃-95℃，而長期加熱，會影響水的活性，形成老化水。

（4）飲水機中亞硝酸鹽問題。飲水機中的水反復加熱導致亞硝酸鹽含量升高，當水中亞硝酸鹽含量過高時，在胃酸作用下，亞硝酸鹽可生成亞硝胺，該物質可以致癌。